1
Еще в ХVIIв. рассказывали, что монастырь в труднодоступном месте поймы Сейма был основан до татаро-монгольского нашествия.
Во время нашествия, когда в монастыре закончилось продовольствие и монахи готовились покинуть монастырь, Господь просыпал на монастырь крупу (манну небесную), и сохранил монахам жизнь. В память об этом чуде, монастырь стали называть Крупицкий,
а Николаевским стали называть монастырь из-за иконы святого Николая Чудотворца , которая "явилась" монахам одного из монастырских скитов и по сей день хранится в монастыре как святыня.
XVIIв. - период наибольшего расцвета монастыря. Когда Батурин стал гетманской столицей козацкой Украины, козацкая старшина во главе с гетманом Мазепой и словом и делом помогали монастырю. В 1680г. построен каменный соборный храм Святого Николая ( уничтожен советской властью в 1922г.), некоторое время (1682-1683) настоятелем монастыря был Дмитрий Савич Туптало, который в последствии был причислен к лику русских святых как Дмитрий Ростовский.
Спасо-Прображенска церковь построена в 1804г. (восстановлена в 2004г.), колокольня - 1825г.
Второе возрождение монастыря началось в 1999г. уже как Свято-Николаевский Батуринский Крупицкий женский монастырь. ( 2-монахини, 2-послущницы и священник).